Az utazók múltjuk kísérteteivel találkoznak, amikor a saját idősíkjukon haladnak.

Jennifer létrehozza a Hiénákat, hogy megállítsák a 12 majmot és a vírus visszaszerzésére irányuló tervüket.

Cole utolsó kísérlete, hogy megállítsa a 12 majom seregét Tokióba viszi vissza, 1987-be.

Cole-nak, Raillynek és Aaronnek meg kell akadályoznia, hogy egy vírust biofegyverként használjanak Csecsenföldön.

Egy elmegyógyintézetben lévő beteg lehet a járvány terjedésének kulcsa.